Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms