Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms