Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms