Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDXQ7Z353 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDXQ7Z353 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDXQ7Z353 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDXQ7Z353 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDXQ7Z353 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDXQ7Z353 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDXQ7Z353 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDXQ7Z353 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDXQ7Z353 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDXQ7Z353 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HDXQ7Z353 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDXQ7Z353 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDXQ7Z353 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDXQ7Z353 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDXQ7Z353 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDXQ7Z353 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HDXQ7Z353 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HDXQ7Z353 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HDXQ7Z353 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms