Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRCQ7RTU9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRCQ7RTU9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRCQ7RTU9 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRCQ7RTU9 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRCQ7RTU9 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRCQ7RTU9 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRCQ7RTU9 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRCQ7RTU9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRCQ7RTU9 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRCQ7RTU9 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRCQ7RTU9 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRCQ7RTU9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRCQ7RTU9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
STRCQ7RTU9 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms