Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms