Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms