Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms