Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG9BQ674R7 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms