Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms