Protein–RNA interactions for Protein: Q5FBB7

SGO1, Shugoshin 1, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1Q5FBB7 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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SGO1Q5FBB7 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SGO1Q5FBB7 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SGO1Q5FBB7 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SGO1Q5FBB7 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SGO1Q5FBB7 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SGO1Q5FBB7 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SGO1Q5FBB7 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SGO1Q5FBB7 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGO1Q5FBB7 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGO1Q5FBB7 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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