Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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