Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SYTL3Q4VX76 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms