Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms