Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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