Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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DDB1Q16531 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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DDB1Q16531 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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