Protein–RNA interactions for Protein: Q16401

PSMD5, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD5Q16401 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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