Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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