Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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SEC23BQ15437 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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SEC23BQ15437 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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SEC23BQ15437 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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SEC23BQ15437 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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SEC23BQ15437 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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SEC23BQ15437 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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