Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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BRD3Q15059 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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