Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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