Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNB1Q14721 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNB1Q14721 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNB1Q14721 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNB1Q14721 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNB1Q14721 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNB1Q14721 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNB1Q14721 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNB1Q14721 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNB1Q14721 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNB1Q14721 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms