Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms