Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms