Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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COL4A6Q14031 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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COL4A6Q14031 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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COL4A6Q14031 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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COL4A6Q14031 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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COL4A6Q14031 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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COL4A6Q14031 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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COL4A6Q14031 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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COL4A6Q14031 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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