Protein–RNA interactions for Protein: Q13686

ALKBH1, Nucleic acid dioxygenase ALKBH1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH1Q13686 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ALKBH1Q13686 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ALKBH1Q13686 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms