Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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FOXE3Q13461 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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FOXE3Q13461 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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FOXE3Q13461 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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FOXE3Q13461 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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FOXE3Q13461 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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