Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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PTPN13Q12923 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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PTPN13Q12923 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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PTPN13Q12923 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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PTPN13Q12923 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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PTPN13Q12923 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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