Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms