Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms