Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms