Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms