Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F1Q01094 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms