Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms