Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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ERVFRD-1P60508 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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ERVFRD-1P60508 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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ERVFRD-1P60508 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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ERVFRD-1P60508 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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ERVFRD-1P60508 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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ERVFRD-1P60508 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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ERVFRD-1P60508 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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