Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms