Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME5P56597 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME5P56597 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME5P56597 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME5P56597 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME5P56597 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME5P56597 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME5P56597 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME5P56597 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME5P56597 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME5P56597 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME5P56597 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME5P56597 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME5P56597 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME5P56597 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms