Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms