Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTAP49354 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTAP49354 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTAP49354 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTAP49354 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTAP49354 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTAP49354 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTAP49354 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTAP49354 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTAP49354 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTAP49354 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTAP49354 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTAP49354 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTAP49354 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTAP49354 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTAP49354 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTAP49354 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTAP49354 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTAP49354 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTAP49354 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTAP49354 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTAP49354 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTAP49354 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTAP49354 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTAP49354 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTAP49354 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTAP49354 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTAP49354 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTAP49354 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTAP49354 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTAP49354 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTAP49354 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTAP49354 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTAP49354 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTAP49354 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTAP49354 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTAP49354 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTAP49354 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTAP49354 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTAP49354 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTAP49354 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.3 ms