Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB2P47870 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms