Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGER3P43115 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms