Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms