Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA3P42263 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms