Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC26A3P40879 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms