Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBRP36941 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBRP36941 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBRP36941 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBRP36941 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBRP36941 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBRP36941 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBRP36941 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBRP36941 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBRP36941 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBRP36941 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBRP36941 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBRP36941 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBRP36941 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBRP36941 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBRP36941 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBRP36941 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBRP36941 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBRP36941 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBRP36941 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBRP36941 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBRP36941 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBRP36941 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBRP36941 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBRP36941 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBRP36941 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBRP36941 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBRP36941 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBRP36941 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBRP36941 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBRP36941 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBRP36941 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBRP36941 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBRP36941 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBRP36941 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBRP36941 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBRP36941 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBRP36941 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBRP36941 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBRP36941 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBRP36941 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBRP36941 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBRP36941 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBRP36941 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBRP36941 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBRP36941 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBRP36941 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms