Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
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