Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CALB2P22676 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CALB2P22676 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CALB2P22676 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CALB2P22676 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CALB2P22676 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CALB2P22676 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CALB2P22676 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CALB2P22676 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CALB2P22676 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CALB2P22676 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CALB2P22676 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CALB2P22676 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CALB2P22676 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CALB2P22676 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CALB2P22676 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CALB2P22676 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CALB2P22676 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CALB2P22676 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CALB2P22676 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CALB2P22676 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CALB2P22676 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CALB2P22676 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CALB2P22676 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALB2P22676 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms