Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRHP20396 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRHP20396 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRHP20396 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRHP20396 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRHP20396 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRHP20396 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRHP20396 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRHP20396 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRHP20396 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRHP20396 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRHP20396 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRHP20396 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRHP20396 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRHP20396 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRHP20396 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRHP20396 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRHP20396 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRHP20396 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRHP20396 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRHP20396 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRHP20396 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRHP20396 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRHP20396 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRHP20396 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRHP20396 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRHP20396 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRHP20396 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRHP20396 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRHP20396 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRHP20396 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRHP20396 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRHP20396 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRHP20396 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRHP20396 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRHP20396 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRHP20396 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRHP20396 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRHP20396 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRHP20396 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRHP20396 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRHP20396 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRHP20396 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TRHP20396 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TRHP20396 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TRHP20396 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TRHP20396 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRHP20396 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRHP20396 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRHP20396 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRHP20396 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRHP20396 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRHP20396 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRHP20396 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRHP20396 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRHP20396 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRHP20396 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRHP20396 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRHP20396 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRHP20396 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRHP20396 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRHP20396 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRHP20396 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRHP20396 AC022966.2-201ENST00000587434 367 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRHP20396 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRHP20396 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRHP20396 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRHP20396 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRHP20396 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRHP20396 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRHP20396 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRHP20396 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRHP20396 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRHP20396 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRHP20396 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRHP20396 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRHP20396 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRHP20396 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRHP20396 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRHP20396 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRHP20396 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRHP20396 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRHP20396 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRHP20396 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRHP20396 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRHP20396 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRHP20396 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRHP20396 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRHP20396 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRHP20396 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRHP20396 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRHP20396 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRHP20396 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRHP20396 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRHP20396 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRHP20396 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRHP20396 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRHP20396 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRHP20396 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRHP20396 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms