Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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