Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB1P16220 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB1P16220 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB1P16220 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB1P16220 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB1P16220 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB1P16220 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB1P16220 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB1P16220 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB1P16220 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB1P16220 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB1P16220 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB1P16220 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB1P16220 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB1P16220 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB1P16220 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB1P16220 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB1P16220 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB1P16220 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB1P16220 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB1P16220 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB1P16220 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB1P16220 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB1P16220 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB1P16220 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB1P16220 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB1P16220 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB1P16220 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB1P16220 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB1P16220 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB1P16220 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB1P16220 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB1P16220 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB1P16220 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB1P16220 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB1P16220 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB1P16220 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB1P16220 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB1P16220 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB1P16220 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB1P16220 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB1P16220 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB1P16220 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB1P16220 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB1P16220 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB1P16220 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB1P16220 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB1P16220 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB1P16220 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB1P16220 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB1P16220 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB1P16220 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB1P16220 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB1P16220 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB1P16220 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB1P16220 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB1P16220 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB1P16220 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB1P16220 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB1P16220 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB1P16220 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB1P16220 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB1P16220 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB1P16220 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB1P16220 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB1P16220 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB1P16220 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB1P16220 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB1P16220 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB1P16220 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB1P16220 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB1P16220 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB1P16220 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB1P16220 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB1P16220 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB1P16220 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB1P16220 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB1P16220 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB1P16220 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB1P16220 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB1P16220 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB1P16220 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB1P16220 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB1P16220 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB1P16220 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB1P16220 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB1P16220 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB1P16220 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB1P16220 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB1P16220 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB1P16220 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB1P16220 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB1P16220 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB1P16220 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB1P16220 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB1P16220 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB1P16220 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB1P16220 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB1P16220 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB1P16220 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms